1.1 α-Helices. α-spiralė yra įprastas b altymo antrinės struktūros elementas, susidarantis , kai aminorūgštys „susivynioja“ir sudaro dešiniąją spiralę, kur šoninės grandinės nukreiptos iš centrinės ritės (3.1A, B pav.).
Dėl ko susidaro alfa spiralės?
Alfa spiralei būdingas įtemptas dešinės rankos posūkis aminorūgščių grandinėje, dėl kurio ji suformuoja lazdelės formą. Vandeniliniai ryšiai tarp vandenilio amino grupėje ir deguonies karboksilo grupėje aminorūgštyje sukelia tokią struktūrą.
Kaip susidaro alfa spiralės ir beta versijos lakštai?
Alfa spiralė susidaro, kai polipeptidinės grandinės susisuka į spiralę Tai leidžia visoms grandinėje esančioms aminorūgštims sudaryti vandenilinius ryšius viena su kita.… Beta klostuotas lapas yra polipeptidinės grandinės, einančios viena šalia kitos. Dėl bangos išvaizdos jis vadinamas klostuotu lakštu.
Kokios aminorūgštys sudaro spiralę?
Įvairios aminorūgščių sekos turi skirtingą polinkį formuoti α-spiralinę struktūrą. Metioninas, alaninas, leucinas, glutamatas ir lizinas neįkrauti ("MALEK" aminorūgščių 1 raidės koduose) turi ypač didelį polinkį formuoti spiralę, o prolinas ir glicinas yra silpni spiralės formavimosi polinkiai.
Kaip iš pirminės struktūros susidaro antrinė b altymo struktūra?
Pirminė b altymo struktūra apibrėžiama tik pagal jo aminorūgščių seką ir yra sudaryta peptidiniais ryšiais tarp gretimų aminorūgščių liekanų. Antrinė struktūra atsiranda dėl vandenilinio ryšio išilgai polipeptido pagrindo, todėl susidaro alfa spiralės ir beta klostuoti lakštai.
