SDS stipriai jungiasi su teigiamai įkrautomis ir hidrofobinėmis b altymų liekanomis per savo sulfato grupes ir alkilo grandines , atitinkamai13 Atitinkamai, tai vertingas ploviklis struktūrinės biologijos ir b altymų lankstymo/išsiskleidimo tyrimų srityje.
Ką SDS daro b altymui?
SDS yra amfipatinė aktyvioji paviršiaus medžiaga. Jis denatūruoja b altymus, prisijungdamas prie b altymų grandinės savo angliavandenilio uodega, atidengdamas normaliai palaidotas sritis ir padengdamas b altymų grandinę paviršinio aktyvumo medžiagų molekulėmis. SDS poliarinė galvučių grupė suteikia papildomos naudos naudojant šį denatūrantą.
Kaip SDS jungiasi su aminorūgštimis?
SDS turi hidrofobinę uodegą, kuri stipriai sąveikauja su b altymų (polipeptidų) grandinėmis. SDS molekulių, kurios jungiasi su b altymu, skaičius yra proporcingas b altymą sudarančių aminorūgščių skaičiui Kiekviena SDS molekulė turi du neigiamus krūvius, viršijančius bet kokį galimą b altymo krūvį.
Ar SDS dengia b altymus?
SDS taip pat padengia b altymą vienodu neigiamu krūviu, kuris užmaskuoja vidinius R grupių krūvius. SDS gana tolygiai jungiasi su linijiniais b altymais (apie 1,4 g SDS/1 g b altymo), o tai reiškia, kad b altymo krūvis dabar yra maždaug proporcingas jo molekulinei masei.
Kaip SDS suteikia b altymams neigiamą krūvį?
SDS yra ploviklis, kurio sudėtyje yra ilga alifatinė grandinė ir sulfatų grupė. Šis ploviklis sąveikauja su denatūruotais b altymais , sudarydamas stipriai neigiamai įkrautą kompleksą (neigiamas krūvis, atsirandantis dėl SO42 − SDS grupės). B altymai pirmiausia denatūruojami šiluma, o tada pridedamas didelis SDS perteklius.