BigWig yra failo formatas, skirtas tankiems, nuolatiniams duomenims rodyti genomo naršyklės takelyje, sukurtas konvertuojant iš Wiggle (WIG) formato. BigWig formatas aprašytas UCSC Genome Bioinformatics svetainėje, o Broad Institute failų formatų vadove pateikiama papildomos informacijos.
Kas yra bigWig formatas?
BigWig formatas yra skirtas tankiems, nuolatiniams duomenims, kurie bus rodomi kaip grafikas, rodyti BigWig failai iš pradžių sukuriami iš WIG tipo failų, naudojant UCSC programą wigToBigWig. Arba bigWig failus galima sukurti iš bedGraph failų, naudojant UCSC programą bedGraphToBigWig.
Kaip naudoti bigWig failą?
Perkelkite naujai sukurtą bigWig failą (myBigWig.bw) į žiniatinklyje pasiekiamą http, https arba ftp vietą. Įklijuokite URL į tinkinto takelio įvedimo formą arba sukurkite tinkintą takelį naudodami vieną takelio eilutę. Įklijuokite tinkintą takelio eilutę į pasirinkto takelio tvarkymo puslapio teksto laukelį.
Kas yra bigWig takelis?
bigWig Tracks yra takeliai, skirti nuolatiniams signalams visame genome. Jie tinka rodyti įvairius „neapdorotus“eksperimento rezultatus, pvz., ChIP-Seq signalus, RNA-Seq signalus ir kt.
Kaip sukurti bigWig failą?
Yra keletas būdų, kaip generuoti didelius failus. Tai paprastai apima konvertavimą. bam failą į judėjimo takelį (. wig) ir tada konvertuoti judėjimo takelį į dvejetainį bigwig (.
